中国是栽培高粱最早的国家之一，至少有5000年的悠久历史。我国古书中记载高粱的别名很多种，如蜀林、蜀黍、芦襟、荻粱、乌禾等。中国高粱农艺性状有别于非洲起源的高粱有自己独特的表型因此中国高粱的起源问题一直处于争论之中。归纳起来主要有2种看法：一是非洲起源，经印度传入中国。二是中国本土起源。但是近来有分子研究表明，中国本土起源的证据不充分，Li等于2009年利用叶绿体基因组SSR标记分析了185个中国高粱地方品种70个分别来自非洲东亚北美洲代表着不同类型的国外高粱种质资源的遗传多样性，聚类分析表明中国高粱与国外高粱不能清楚地区分开来；2010年Zhang等利用核基因组SSR标记分析了同样的材料研究结果与之前的结果一致支持中国高粱非洲起源学说。

       非洲是高粱种变异最多的地方，1882年Condolle首次提出高粱起源于非洲。斯诺顿（1935）收集到的17种野生种高粱中，有16种来自非洲。他所确定的31个栽培品种里，非洲占28品种；158个变种里，只有4个品种在非洲以外的地方。另外，人类最早的食用高粱被发现于非洲莫桑比克的一个溶洞当中，距今有10.5万年的石器上面粘着当地的高粱颗粒。