新修订的《农业行政处罚程序规定》主要针对原规定中不符合新《行政处罚法》的条款作了修订，调整了农业行政处罚程序的适用范围，细化了农业行政处罚案件从立案、调查取证、查封扣押到送达执行的程序规则，修改了农业行政处罚的适用规则和审查条件，完善了行政处罚和刑事司法衔接等机制。